Le port de New York fonctionne comme la porte maritime de la ville depuis 1624, lorsque des commerçants néerlandais ont jeté l'ancre à la pointe sud de l'île de Manhattan. La voie navigable s'étend sur 650 miles carrés, englobant l'estuaire du fleuve Hudson, le détroit de marée de l'East River et l'Upper Bay où se dresse la Statue de la Liberté sur Liberty Island. À la fin du XIXe siècle, plus de soixante-dix pour cent de toutes les importations américaines transitaient par ce port. Le tonnage de fret a atteint son apogée en 1951, puis a décliné à mesure que la conteneurisation a déplacé les opérations de fret vers les terminaux du New Jersey. Aujourd'hui, le port dessert des navires de plaisance, des ferries de banlieue et des bateaux de tourisme qui partent de Chelsea Piers, Battery Park et du South Street Seaport. Une excursion privée en bateau à New York suit des itinéraires qui font le tour de Manhattan — une boucle de trente-deux miles nécessitant environ deux heures et demie à vitesse de croisière — ou des itinéraires plus courts se concentrant sur la Statue de la Liberté, Ellis Island et la skyline sud. La voie navigable reste un canal de navigation actif ; remorqueurs, barges et navires des garde-côtes partagent les voies avec les opérateurs touristiques. Les navires de charter privés vont des cabin cruisers de trente pieds aux yachts de soixante pieds équipés de ponts ouverts, de salons fermés et d'un service de cuisine à bord. La plupart des opérateurs proposent des départs au coucher du soleil synchronisés avec la lumière de l'horizon occidental au-dessus du New Jersey, lorsque les façades vitrées du Lower Manhattan reflètent des tons ambrés et rosés. Le pont Verrazano-Narrows, achevé en 1964 et long de 4 260 pieds, marque la limite sud du port où les Narrows relient l'Upper Bay et la Lower Bay. Governors Island, une ancienne installation militaire de 172 acres ouverte au public en 2003, se situe à mi-chemin entre Brooklyn et Manhattan. La navigation portuaire nécessite une connaissance des courants de marée, qui inversent leur direction toutes les six heures et peuvent atteindre des vitesses de trois nœuds dans le passage de Hell Gate sur l'East River. Les capitaines brevetés possèdent des accréditations USCG et maintiennent un contact radio VHF avec le service de trafic maritime. Les réservations de charter effectuées par des opérateurs vérifiés incluent une couverture responsabilité civile et le respect des limites de passagers fixées par le certificat d'inspection du navire. La qualité de l'eau du port s'est considérablement améliorée depuis le Clean Water Act ; les niveaux d'oxygène dissous permettent désormais de soutenir les populations de bars rayés, de tacauds et de limandes, qui attirent les pêcheurs amateurs toute l'année.